手术治疗是采用保守治疗治疗便秘的方法经过一段仍无效者，可通过一些检查手段，看是否存在着器质性病变。即有否需要经手术治疗的外科疾患。
慢运输型便秘的手术条件：
①结肠无张力;
②无出口梗阻;
③除外肠易激综合征。可做结肠段或次全切手术。
出口梗阻性便秘：
此类病进行排粪造影检查，可诊断。包括：
①直肠前突：采用修补阴道后壁或直肠前壁的方法解决;
②直肠内脱垂：治疗常采用结扎直肠粘膜以缩短长度，也可注射硬化剂加手术结扎的综合疗法;
③盆腔痉挛综合征(又叫盆底失弛缓综合征)：可用切除部分耻骨直肠肌的手术方法。
治疗便秘的手术方式：
手术切除和穴位刺激治疗以及纠正手术等。
1、便秘比较严重时，有可能是结肠病变而引起的，对于这一类，便秘可以采取手术切除结肠的方式进行治疗。
2、穴位刺激治疗便秘也是常用的方式。一般会通过穴位埋线手术来治疗便秘。
3、纠正手术也是治疗便秘的手术方式，