针灸治疗便秘多取大肠俞、募穴及三焦、肾经穴为主。主穴如支沟、天枢、照海、大肠俞、左水道。热盛，加曲池、合谷；气滞，加中脘、太冲；气血两亏，加脾俞、胃俞、足三里；下焦虚寒者灸神阙，气海。实秘用泻法，以清热润肠，疏肝理气；虚秘用补法，以补益气血，润肠通便；寒秘加灸以温下焦通便秘。
天枢为大肠募穴，大肠俞为大肠背俞穴，募俞相配，以疏通大肠腑气，腑气通则传导功能复常，便秘可通。
支沟为三焦经火穴，可宣泄三焦之火以通便；照海穴滋肾水以增液润肠。《玉龙歌》曰：“大便闭结不能通，照海分明在足中，更把支沟来泻动，方知妙穴有神功。”曲池、合谷泻大肠腑气以泄热通便；中脘疏通三焦，太冲疏肝理气以通肠腑；补脾俞、胃俞、足三里，扶助中气，脾胃气旺，则能生化气血，为虚秘治本之法；灸神阙、气海，温下焦理气滞以通便；左水道是治疗便秘的经验穴,水道穴位于肚脐以下大约3寸，关元穴左右两侧各向两旁大约2寸处。左侧名左水道，右侧名右水道。