肛门、直肠、结肠的各种疾病均属于肛肠科诊治范畴。
1、内痔，外痔，混合痔，肛裂，肛周脓肿，肛瘘等肛周常见病;
2、溃疡性结肠炎，克罗恩病等大肠炎症性疾病;
3、结直肠癌，结直肠息肉等结直肠肿瘤性疾病;
4、便秘，直肠前突，会阴下降，肛门坠胀，肛门失禁等盆底功能障碍性疾病;
5、肛周湿疹，肛周炎，肛门瘙痒症，尖锐湿疣等肛周皮肤病及性传播疾病;
6、肛门直肠狭窄或闭锁，先天性巨结肠等肛门直肠先天畸形;
7、藏毛窦，骶前囊肿，畸胎瘤，直肠阴道瘘，子宫内膜异位症等肛肠科少见疾病。
肛肠外科作为一个新兴的医学学科，近年来在基础和临床方面都有了突破性进展，新的基础理论和手术方式不断出现，一些传统的手术方式也在发生着改变，使得肛肠外科手术领域在拓宽，手术难度在增多，手术禁区在突破，手术的专科性也越来越明显，使肛肠外科的内涵和外延都发生着深刻的变化。